El trabajo del Instituto Lincoln está organizado en cinco áreas principales: Planificación y Forma Urbanística, Valuación y Tributación, Iniciativas Internacionales e Institucionales, el Programa para la República Popular de China y el Programa para América Latina y el Caribe.

El Departamento de Planificación y Forma Urbanística aborda los mayores desafíos globales de su trabajo en desarrollo urbano, conservación del suelo y el Oeste Intermontañoso.
El Departamento de Valuación y Tributación proporciona información para facilitar la toma de decisiones en temas relacionados con la tributación del suelo, por medio de investigación, docencia y recopilación de datos.
El Departamento de Iniciativas Internacionales y Transversales supervisa proyectos y campañas para todo el Instituto, incluyendo la campaña para promover la salud fiscal municipal.
El Programa para China explora temas y desafíos relacionados con políticas tributarias y de suelo en China, enfocándose en el desarrollo urbano rápido, políticas básicas de suelo y reforma tributaria.
Utilizando la experiencia acumulada en la región desde 1993, el Programa lidera los esfuerzos en siete áreas claves, respaldados por una creciente red de investigadores y profesionales en América Latina.